《生物工程學報》(Chinese Journal of Biotechnology)是由中國科學院微生物研究所和中國微生物學會主辦、 國內外公開發行的綜合性學術期刊。1985年創刊，現為月刊。《生物工程學報》已被美國化學文摘CA、美國生物學文摘BA、美國醫學索引IM/MEDLINE、俄羅斯文摘AJ、日本科學技術社數據庫JST、英國國際農業與生物科學研究文摘CABI、美國劍橋科學文摘(自然科學卷)CSA(NS)、波蘭哥白尼索引IC、荷蘭Elsevier的Scopus、荷蘭醫學文摘EMBASE、中國科學引文數據庫、萬方數據庫及中國電子期刊光盤版等檢索系統收錄，是北大中文核心期刊、中國科技核心期刊、CSCD核心期刊和中國科技期刊卓越行動計劃入選期刊。

　　《生物工程學報》主要報道動物、植物、微生物以及醫學等生物工程相關領域的新發展、新成果、新技術，以及高校生物學教學研究改革等，主要欄目有：綜述、動物及獸醫生物技術、海洋生物技術、合成生物技術、環境生物技術、工業生物技術、農業生物技術、食品生物技術、醫藥生物技術、組織工程與細胞培養、生物技術與方法、生物育種與工藝優化、科學進展/專家評述/觀點、高校生物學教學等