生物工程學(xué)報(bào)最新期刊目錄

天冬氨酸蛋白酶基因AhAP12在花生結(jié)瘤中的功能解析————作者：何海通;劉偉晴;王燦;朱瑤瑤;張威;孔照勝;王利祥;

摘要：花生(Arachis hypogaea L.)是我國(guó)重要的油料和經(jīng)濟(jì)作物之一，其與根瘤菌形成的共生固氮體系具有重要的農(nóng)業(yè)及生態(tài)價(jià)值。天冬氨酸蛋白酶家族在植物抗逆和激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮重要作用，但其在豆科植物結(jié)瘤固氮中的功能尚未明確。本研究通過生物信息學(xué)分析鑒定到一個(gè)在花生根瘤中特異性表達(dá)的天冬氨酸蛋白酶家族基因AhAP12，該基因快速響應(yīng)根瘤菌的侵染。亞細(xì)胞定位表明AhAP12定位于細(xì)胞核與細(xì)胞膜。...

一種源于綠僵菌的酪氨酸蛋白磷酸酶新特征序列鑒定及其酶學(xué)特性分析————作者：譚澤;朱培;李振輪;楊水英;

摘要：酪氨酸蛋白磷酸酶（protein tyrosine phosphatase， PTP）是調(diào)控細(xì)胞過程的關(guān)鍵酶，其催化活性依賴特征序列（H/V）CX₅R（S/T），其中半胱氨酸和精氨酸為關(guān)鍵殘基。綠僵菌胞外磷酸酶mRNA前體剪接產(chǎn)生2個(gè)差異基因序列，其中較長(zhǎng)序列包含新序列HCPTPMLS，該序列與PTP特征序列相似但缺失精氨酸殘基。為了鑒定新特征序列和分析其酶學(xué)特性，本研究通過...

l-草銨膦的多酶級(jí)聯(lián)制備工藝————作者：汪曼曼;楊宇;宋顯炳;李小連;李彬春;王自強(qiáng);

摘要：l-草銨膦(l-phosphinothricin， l-PPT)是一種高效的廣譜除草劑。為實(shí)現(xiàn)l-PPT的多酶催化制備，本研究構(gòu)建了大腸桿菌(Escherichia coli) YM-1工程菌株高效表達(dá)d-氨基酸轉(zhuǎn)氨酶，催化d-草銨膦(d-phosphinothricin， d-PPT)生成中間體2-羰基-4-(羥基甲基膦酰基)丁酸{2-oxo-4-[(hydroxy)(methyl)phosph...

巴氏葡萄球菌遺傳操作系統(tǒng)的建立與優(yōu)化————作者：張廷昊;王子奇;宋宇欣;王津津;郭鳳;張永君;路福平;黎明;

摘要：菌株對(duì)1，4-丁二胺耐受性低是1，4-丁二胺高產(chǎn)的技術(shù)瓶頸之一，提高菌株對(duì)1，4-丁二胺的耐受性是構(gòu)建高產(chǎn)1，4-丁二胺工程菌株需要解決的主要問題。巴氏葡萄球菌326180菌株展現(xiàn)出了優(yōu)異的高濃度1，4-丁二胺耐受性，不僅可以作為研究1，4-丁二胺耐受機(jī)制的理想模型，還可以為構(gòu)建1，4-丁二胺高產(chǎn)工程菌株提供新的宿主選擇。無論是耐受機(jī)制研究還是底盤菌株改造，都需要在分子水平上對(duì)巴氏葡萄球菌進(jìn)行基因...

納米流式技術(shù)定量檢測(cè)腺病毒載體疫苗的病毒顆粒————作者：史卓維;張穎;田清雅;王自強(qiáng);邵泓;

摘要：本研究旨在建立腺病毒載體疫苗病毒顆粒數(shù)的檢測(cè)方法。采用納米流式技術(shù)在單顆粒水平上對(duì)腺病毒載體疫苗的病毒顆粒數(shù)進(jìn)行分析，選擇與病毒折射率接近的單分散二氧化硅納米顆粒作為標(biāo)準(zhǔn)粒徑參考品，計(jì)算病毒的粒徑，并與透射電子顯微鏡測(cè)定結(jié)果比較，從而確定圈門策略，再通過顆粒數(shù)標(biāo)準(zhǔn)品計(jì)算病毒顆粒數(shù)。經(jīng)驗(yàn)證，建立的方法線性、準(zhǔn)確度、中間精密度和專屬性良好，病毒顆粒數(shù)測(cè)定結(jié)果與感染性滴度有良好的相關(guān)性。相較于傳統(tǒng)OD<...

基于腸道菌群健康指數(shù)的膳食因子評(píng)估方法開發(fā)————作者：楊子欣;謝和強(qiáng);朱金林;王鴻超;陸文偉;

摘要：腸道菌群與人體健康密切相關(guān)，目前已有多種腸道菌群健康指數(shù)，以輔助評(píng)價(jià)腸道菌群乃至人體健康。膳食是調(diào)節(jié)腸道菌群的主要因素之一，但尚無合適的方法用于評(píng)價(jià)膳食因子調(diào)節(jié)效果。為了評(píng)估膳食因子對(duì)超重人群腸道菌群的調(diào)控效果，基于17種膳食因子進(jìn)行了體外發(fā)酵實(shí)驗(yàn)，并使用基于主成分分析的腸道菌群健康指數(shù)(health index with principal component analysis， hiPCA)構(gòu)...

全酶法解聚滌棉紡織品回收聚酯單體對(duì)苯二甲酸————作者：汪宏釗;寸云濤;王旻烜;楊振武;何皓;朱玉山;

摘要：聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯(polyethylene terephthalate， PET)制成的纖維具有良好的機(jī)械強(qiáng)度，其與棉纖維混紡制成的衣物兼具舒適性和耐用性，是生活中最常見的紡織品。然而，廢棄滌棉紡織品的不當(dāng)處置已成為日益嚴(yán)重的環(huán)境污染源。與其他回收方法相比，采用酶法解聚紡織品，不僅對(duì)環(huán)境更加友好，在工業(yè)中還具有更大的應(yīng)用潛力。本研究旨在探索一種大規(guī)模的廢舊紡織品處理方案，針對(duì)滌棉混紡織物的資源...

噬菌體免疫沉淀測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展————作者：朱宇浩;朱文龍;賴妤婕;張夢(mèng)佳;李文濤;

摘要：噬菌體免疫沉淀測(cè)序技術(shù)(phage immunoprecipitation sequencing， PhIP-Seq)是一種高通量、低成本分析目標(biāo)蛋白與肽庫(kù)特異性結(jié)合的方法。該方法使用寡核苷酸文庫(kù)合成(oligonucleotide library synthesis， OLS)來編碼蛋白質(zhì)組規(guī)模的肽庫(kù)以展示在噬菌體上，然后使用目標(biāo)蛋白(抗體等)免疫沉淀這些文庫(kù)噬菌體，以便隨后通過高通量DNA測(cè)序...

水稻htd1等位突變體的鑒定及其對(duì)粒型的調(diào)控作用————作者：楊宇琪;張芷寧;劉雋;唐璐瑤;魏毅鋌;農(nóng)雯;尹璐;李三峰;段朋根;王躍星;饒玉春;

摘要：水稻是世界第一大糧食作物，其產(chǎn)量和品質(zhì)直接關(guān)系到糧食安全和人類健康。水稻粒型是決定產(chǎn)量的重要因素之一，長(zhǎng)期以來受到研究人員的廣泛關(guān)注。為進(jìn)一步研究水稻粒型的調(diào)控機(jī)制，本研究以粳稻品種‘中花11’(‘ZH11’)為背景，通過甲基磺酸乙酯(ethyl methanesulfonate， EMS)誘變獲得了一個(gè)多蘗矮桿小粒突變體htd1，并對(duì)其粒型調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了深入研究。遺傳分析表明htd1的表型受到單...

土壤調(diào)理劑對(duì)赤霞珠根際細(xì)菌群落的影響————作者：安帥丞;畢江濤;李功;毛瑞璠;劉鵬;惠治兵;蘇小琴;

摘要：將餐廚固廢和腐熟牛糞等分別與脫硫石膏、煤矸石、麥飯石復(fù)配造粒成3種土壤調(diào)理劑，在赤霞珠(Cabernet Sauvignon)鹽漬化種植地開展田間試驗(yàn)，分析其對(duì)根際細(xì)菌群落的影響，以期為土壤改良和修復(fù)提供科學(xué)依據(jù)。試驗(yàn)設(shè)T1(對(duì)照)、T2(常規(guī)施肥)、T3(化肥減施+有機(jī)質(zhì)型含鈣土壤調(diào)理劑)、T4(化肥減施+有機(jī)質(zhì)型含硅土壤調(diào)理劑)、T5(化肥減施+有機(jī)質(zhì)型含鎂土壤調(diào)理劑)處理，重復(fù)3次。結(jié)果表明...

阿維鏈霉菌細(xì)胞上清液生物合成納米硒的表征及其機(jī)制————作者：張琪;李敬文;郭嘉欣;周榮娟;李亞妮;岳思君;

摘要：為了探究阿維鏈霉菌（Streptomyces avermitilis）細(xì)胞上清液生物合成納米硒（selenium nanoparticles， SeNPs）的還原機(jī)理和穩(wěn)定機(jī)制，本研究利用細(xì)胞上清液作為還原體系來制備SeNPs，采用電感耦合等離子體發(fā)射光譜儀（inductively coupled plasma-optical emission spectrometer， ICP-OES）對(duì)SeN...

高通量篩選技術(shù)在放線菌菌株改造中的應(yīng)用————作者：劉雪巖;王猛;劉繼鋒;張玥;

摘要：放線菌是重要的高附加值天然產(chǎn)物生產(chǎn)宿主，改造放線菌以高效獲取目標(biāo)天然產(chǎn)物一直是科學(xué)界的熱點(diǎn)研究方向。非理性菌株改造方法的正突變率低，而結(jié)合高通量篩選方法可以有效提高優(yōu)秀突變菌株的篩選效率，并顯著縮短放線菌菌株改造的周期。本文系統(tǒng)介紹了適用于放線菌菌株改造的各種高通量篩選技術(shù)，并從適用場(chǎng)景、優(yōu)缺點(diǎn)等方面進(jìn)行了比較，涵蓋微孔板篩選、抑菌活性篩選、抗生素抗性篩選、熒光激活細(xì)胞分選和熒光激活液滴分選。同時(shí)...

信號(hào)分子酰基高絲氨酸內(nèi)酯調(diào)控下希瓦氏菌生物膜的形成及其在UO₂²⁺電吸附中的應(yīng)用————作者：劉婷婷;舒鴻;李乾;崔朝;李廣悅;李婷;王永東;孫靜;

摘要：奧奈達(dá)希瓦氏菌(Shewanella oneidensis MR-1)對(duì)廢水中鈾的吸附還原具有明顯作用，且是一種具有群體感應(yīng)效應(yīng)的革蘭氏陰性菌，可通過添加外源信號(hào)分子[如酰基高絲氨酸內(nèi)酯(acyl-homoserine lactones， AHLs)]來誘導(dǎo)群體感應(yīng)行為而快速形成生物膜，從而提高對(duì)鈾污染水體的修復(fù)效率。胞外聚合物(extracellular polymeric substances...

解脂耶氏酵母異源合成倍半萜的研究進(jìn)展————作者：王柳歡;邵語(yǔ)瑤;崔嘯林;楊佳珂;喬燕;徐龍興;孫悅嘉;劉鵬才;袁麗杰;劉順成;

摘要：倍半萜是一種含有15個(gè)碳原子的天然萜類化合物。因其具有顯著的生物活性，被廣泛應(yīng)用于香料、醫(yī)藥和生物燃料工業(yè)領(lǐng)域。傳統(tǒng)倍半萜生產(chǎn)依賴于化學(xué)合成或植物組織提取，存在產(chǎn)率低、資源浪費(fèi)等缺點(diǎn)。通過合成生物學(xué)手段構(gòu)建微生物細(xì)胞工廠為高效合成倍半萜提供了新的選擇。近年來，隨著代謝工程和合成生物學(xué)的發(fā)展，通過代謝工程手段改造油脂酵母——解脂耶氏酵母成功實(shí)現(xiàn)了多種倍半萜類化合物的異源合成。本文綜述了解脂耶氏酵母異...

油菜金屬耐受蛋白基因BnMTP10參與錳元素積累調(diào)控————作者：賀玉婷;李宗玥;王晶琳;趙星宇;陳思穎;劉思宏;顧天宇;高艷;唐新科;彭佳師;

摘要：環(huán)境中錳(Mn)等微量礦質(zhì)元素缺乏或過量脅迫是油菜(Brassica napus L.)等作物生產(chǎn)中的常見限制因素。為了鑒定油菜中介導(dǎo)Mn轉(zhuǎn)運(yùn)的關(guān)鍵基因，并解析其作用機(jī)理，選取前期利用Mn脅迫條件篩選油菜cDNA文庫(kù)得到的MTP (metal tolerance protein)家族成員基因?yàn)檠芯繉?duì)象。依據(jù)序列信息和進(jìn)化樹分析結(jié)果，將其命名為BnMTP10，其屬于Mn-CDF (cation di...

新質(zhì)蛋白：機(jī)遇與挑戰(zhàn)————作者：李兆豐;孔昊存;劉瀟;陳堅(jiān);

摘要：新質(zhì)蛋白是生物制造技術(shù)高速發(fā)展背景下產(chǎn)生的新型蛋白資源，其不依賴傳統(tǒng)畜牧業(yè)或傳統(tǒng)漁業(yè)方式，具有資源節(jié)約、低碳環(huán)保、生產(chǎn)效率高等優(yōu)勢(shì)，有望部分替代傳統(tǒng)動(dòng)物蛋白，正逐漸成為推動(dòng)經(jīng)濟(jì)發(fā)展的重要抓手，對(duì)加快發(fā)展新質(zhì)生產(chǎn)力、保障國(guó)家糧食安全、落實(shí)“大食物觀”具有重要意義。本文系統(tǒng)分析了新質(zhì)蛋白的發(fā)展機(jī)遇、挑戰(zhàn)及現(xiàn)狀，可為行業(yè)研究、政策制定及產(chǎn)業(yè)實(shí)踐提供參考，助力我國(guó)新質(zhì)蛋白產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展

導(dǎo)讀————作者：李福利;

摘要：<正>本期聚焦生物工程領(lǐng)域的前沿進(jìn)展，集中展示了從基礎(chǔ)生物元件的設(shè)計(jì)、細(xì)胞工廠的構(gòu)建優(yōu)化，到酶蛋白工程的精細(xì)優(yōu)化，再到復(fù)雜生物過程的系統(tǒng)性分析等多個(gè)關(guān)鍵方向的最新研究成果。特別是丙酮酸生物傳感器構(gòu)建，畢赤酵母細(xì)胞工廠生產(chǎn)二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid, EPA)或白藜蘆醇，代謝工程改造大腸桿菌生產(chǎn)沒食子酸和D-塔格糖，定向進(jìn)化放線桿菌高產(chǎn)丁二酸，基于多組學(xué)解析...

微生物法合成金屬納米粒子的機(jī)制及應(yīng)用————作者：王馨若;胡巢寧;王陽(yáng)陽(yáng);宋奧琪;湯睿;李鋒;宋浩;

摘要：電子垃圾的快速增長(zhǎng)導(dǎo)致環(huán)境中貴重金屬元素大量積累，引發(fā)了嚴(yán)重的環(huán)境污染與資源浪費(fèi)。相比傳統(tǒng)火法冶金和濕法冶金容易產(chǎn)生較大的環(huán)境污染和碳足跡，利用微生物法合成金屬納米粒子已成為從電子垃圾中回收貴重金屬的綠色環(huán)保冶金工藝。本文首先綜述了微生物細(xì)胞不同結(jié)構(gòu)空間合成金屬納米粒子的機(jī)制。其次介紹了微生物法合成金屬納米粒子在環(huán)境修復(fù)、能源生產(chǎn)、生物催化和生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。最后對(duì)微生物合成金屬納米粒子多樣性開...

P450Diff2：基于擴(kuò)散模型的P450酶序列生成方法————作者：韓旭東;邵曉彤;陳慧敏;戴玉杰;程健;江會(huì)鋒;

摘要：細(xì)胞色素P450酶是自然界中最大的一類氧化還原酶超家族，廣泛參與藥物代謝、植物次生代謝以及環(huán)境污染物轉(zhuǎn)化等重要生物過程。為了生成具有高保真度和多樣性的人工P450酶序列，本研究提出了一種基于擴(kuò)散模型的P450酶序列生成方法——P450Diff2。該模型基于參數(shù)量達(dá)6.4億的EvoDiff-Seq框架進(jìn)行構(gòu)建，并以來自NCBI、Gmind注釋、RNA-Seq組裝和宏基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的1 041 254條...

微生物光電反硝化技術(shù)的研究進(jìn)展————作者：田振軍;張列宇;柏楊巍;衛(wèi)毅梅;白楊;單則霖;郁永坤;

摘要：微生物反硝化過程是水體氮素去除的主要途徑，然而當(dāng)水體中缺乏微生物可利用的有機(jī)物作為電子供體時(shí)，反硝化過程往往難以進(jìn)行。部分反硝化菌可以直接利用太陽(yáng)光激發(fā)半導(dǎo)體礦物質(zhì)或天然有機(jī)質(zhì)產(chǎn)生的光電子進(jìn)行反硝化而無需生物可利用有機(jī)物作為電子供體，這種微生物光電營(yíng)養(yǎng)代謝驅(qū)動(dòng)的反硝化過程簡(jiǎn)稱微生物光電反硝化。微生物光電反硝化現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)打破了以往對(duì)反硝化菌化能異養(yǎng)營(yíng)養(yǎng)模式的認(rèn)知，拓寬了反硝化菌的光電能營(yíng)養(yǎng)代謝新模式...

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